Este fue el título más esperado de la época del Wii. La historia de este videojuego se lleva a cabo cientos de años antes de Ocarina of Time, por lo que, como ya es costumbre para la franquicia, controlaremos a una de las tantas reencarnaciones y precursores de Link. Él vive en una de las islas situadas en el cielo que se conoce como Skyloft, debajo reside la superficie: unas tierras que son conocidas por estar repletas de maldad y oscuridad.
Una de las actividades favoritas de sus aldeanos es perseguir una escultura que está atada a un pájaro gigante. Los concursantes deben montar otro lado para seguirla y atraparla, otro aldeanos aventarán piedras para complicar más la tarea. Este es uno de los tantos mini juegos nuevos que hay en Skywars Sword. Link participa en este festival dentro de un festival y gana. Victorioso recoge a Zelda y, mientras vuelan por las nubes, un impetuoso torbellino negro la absorbe, por lo que es transportada al mundo de la superficie.
